先说结论：认可，而且差距越来越小。
核心差别就三点：
1. 毕业证上几个字不一样。 非全日制（在职研究生主流）毕业证会标注“非全日制”字样，全日制的不写。除此以外，都是双证（学历证+学位证），学信网可查，法律效力完全一样。
2. 学习方式不一样。 在职是周末、假期或网络上课，不耽误你上班；全日制是周一到周五全天在学校脱产学习。
3. 档案和“身份”不一样。 全日制一般要转档案，毕业有派遣证（报到证），算应届生；在职的户口档案一般不转，也没有派遣证。
认可度的真相（大实话版）：
政策层面：早平等了。 教育部2020年就说了两者法律效力平等，2024年人社部又发文要求企事业单位招聘晋升别卡“全日制”。现在考公务员、评职称、落户（像北上广深等19个城市）基本都一视同仁。
企业层面：看你干啥用。
找工作（社招）： 中大型企业招有经验的中高层岗，82%对“非全”和“全日制”执行相同标准。特别是MBA这类专业，有工作经验反而吃香。但如果是应届生校招的基础岗，人家本来就要没经验的小白，那“全日制”可能还是默认选项。
内部晋升/跳槽： 87%的企业把研究生学历当中层管理的优先条件，“非全”和“全日制”加分一样。有调研显示，拿“非全”学历跳槽，平均薪资涨幅能比没读的高27%。
含金量坑点：
别信“免考包过”。 正规“非全”研究生（专业硕士）和全日制考一样的国家统考，分数线、录取标准现在基本统一，想混文凭没门。那种免试入学、只给学位证或结业证的（同等学力申硕、高级研修班），是另一回事，认可度看具体单位。
关键看学校牌子。 人大、复旦这些名校的非全MBA，比某些普通学校的全日制MBA可能还硬气。含金量差异主要来自学校，不是学习方式。
适合人群不一样。 全日制适合刚毕业、能脱产、想搞学术或换赛道的。在职适合有2年以上工作经验、不想丢工作、想提升学历和人脉的在职人员。对于后者，读个非全性价比更高。
咋选？
你工作三年以上，就想在现有赛道上拔高学历、拓展人脉、争取晋升，放心报正规双证的在职研究生（非全日制），别纠结认可度，挑个好学校的好项目更重要。
你要是应届生或刚工作，想全身心读书、换行业、或者走学术道路，老老实实考全日制。